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陈水扁的任期还有17个月，剩下的时间不多，需要解决的难题不少。台湾社会舆论指出，在陈水扁一家弊案缠身、执政没有政绩、泛绿矛盾增加情况下，“法理台独”已经成为他的政治突破口。因此，“法理台独”对台湾的稳定和发展，对两岸关系的威胁没有解除。
“法理台独”“三独素”
“法理台独”是指陈水扁当局在“二阶段宪政改革”名义下，通过把“中华民国宪法”中象征“两岸属于一国”的相关条文，修改为对“台湾共和国”的表述，在“根本大法”中完成“台独的法源建设”，实现把台湾从中国分裂出去的图谋。因此，“法理台独”也被称为“二阶段宪改”、“中华民国第二共和”、“中华民国是台湾”、为台湾提供一部“合身、合用、合时”的“新宪法”、让台湾成为一个“正常、完整、伟大的国家”等。“法理台独”的说法有多种，性质没有变，是在制造要把台湾从中国分裂出去的恶性事变。
从“台独”方面提出的“法理台独”的设想看，关键是根据象征国家的“对内三要素”，完成“台独”的法源架构。关于要素之一的“人民”，陈水扁当局反复宣称，“台湾主权属于2300万人民”，“台湾的前途只有2300万的台湾人民才有权利决定”。这一主张主要通过完成“法理台独”程序中的最后一步“公民投票”来体现。关于要素之二的“政权”，陈水扁当局反复宣称，台湾由选民直接选举产生“总统”和实现政党轮替，则是体现“民主的深化”和“普世价值”。“法理台独”是要在这基础上，彻底放弃以“五权分立”为核心的“中华民国政治体制”，完善“台独”的政治体制。关于要素之三的“领土”，是“法理台独”的重点，要把原来“宪法”总纲第四条对“中华民国”领土的论述，即组成“中华民国固有领土”的“大陆和台澎金马”，改为由台湾当局控制的“现有领土”“台澎金马”，同时取消“台湾省”的建制、完全“废省”，从“领土”的角度确定“台独”。因此，“法理台独”的要害，是要把宣扬“台独”的“国家认同”、“国家定位”、“主体意识”、“台湾主权”等主张，替代有关“大中国”的内容，达到用“宪法”方式确定把台湾从中国分裂出去的目的。
与内容相配合，泛绿军从完成“法理台独”的途径、手段、形式方面提出了许多设想，为“法理台独”清道开路，寻找捷径。如提出直接“制宪”，用制订“台独新宪法”的方式，一步到位，实现“台独”梦想。陈水扁也提出，只要“修宪”达到一定程度，修订条文到一定数量，即成为事实上的“制宪”。修改“国号”和“国旗”是“法理台独”的图谋之一，为了减少“二阶段修宪”本身的阻力，陈水扁当局准备把“国号”、“国旗”单独处理，为蒙混过关创造条件。陈水扁当局正在推动降低“修宪”门槛，便于“法理台独”方案在“立法院”和“公投”时通过。此外，为扩大“法理台独”的声势，泛绿军提出民众和政党都有提案权，为纠集“台独”分子连署“台独宪法”创造条件。显然，在体制内无法主导“修宪和制宪”，在体制外无法获得主流民意支持“法理台独”情况下，泛绿军是在寻找“法理台独”的捷径。
“法理台独”阴谋多
陈水扁当局执政6年多来，一直在利用执政条件和施政舞台，推进“法理台独”。
第一步，是在2002年8月3日，陈水扁正式提出“一边一国论”，确定“法理台独”的目标。第二步，是在2003年9月28日，提出“台独时间表”中，以后“台独三步走”的设想不断调整，2006年初提出了要在2007年进行“台独新宪公投”计划。第三步，是在2003年11月27日制订“公民投票法”，“公投”是泛绿阵营完成“台独”的手段，完成“公投立法”是“法理台独”跨出关键一步。第四步，是在2004年3月20日，陈水扁借助“公投法”中的“防卫性公投”条款，强行举办第一次 | 
