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为了适应市场经济条件下转变政府职能、建立健全公共财政体系的总要求，我国将于2007年1月1日始全面实施政府收支分类改革。这次改革将构建新的政府收入分类体系、支出功能分类体系和支出经济分类体系，是建国以来我国财政收支分类体系最重大的一次调整。这次政府收支分类改革由收入分类、支出功能分类、支出经济分类改革三部分构成。相对水利事业单位而言，收入分类主要涉及到非税收入和预算外资金的归集，此类收入在水利事业单位收入中所占份额很小，其归集和使用对水利事业单位影响不大，因此，水利事业单位主要涉及支出功能分类和支出经济分类改革。
一、支出功能分类与经济分类改革对水利事业单位的影响及应对策略
（一）支出功能分类改革的影响及对策 具体而言：
1、支出功能分类改革的影响。长期以来，我国政府收支分类方法沿用的是计划经济体制的基本框架，滞后于国民经济的市场化进程，主要表现在政府收支分类体系混乱，科目设置重复交叉，并且按照基建、行政费、事业费等多头管理，还包括预算外收支等。按照国际货币基金组织《政府财政统计（2001）》的数据，我国政府的一般性服务支出仅行政管理支出和社会治安支出两项就达到了12.8%，加上预算外中用于这方面的支出，这一比重接近17%，远远高于西方发达国家10%的平均水平，比中、低收入水平国家也要高出2个百分点。同时我国用于社会公共服务行业的支出过低，如教育、卫生、社会保障、水利和环保方面的支出等。从一些统计数据看，我国的行政管理支出过高，公共服务部分投入不足，但由于统计数据来源复杂，支出内容重叠交叉，无法准确反映国家财政的收支内容，其分析比对价值不大。因此，实施政府收支分类改革后，按照新的收支分类范围分析统计数据，便于国际交流和绩效考评。
对于水利事业单位而言，随着国家对功能支出分类划分逐步明细，国家财政对公共支出部分的投资方向和比率必将得到优化和控制，原有的支出将会得到重新评价和定位。以长江水利委员会（以下简称“长江委”）为例。长江委现有行政支出、执行行政管理支出、行业管理支出、科学支出、社会保障机构支出、后勤服务支出、教育支出、医疗支出、工程管理支出、综合服务支出、其他水利支出等等。即长江委的支出包含教育支出、科学技术支出、文化体育与传媒支出、医疗卫生支出、环境保护支出等非水利行业支出，而水利基建支出又在水利支出统计口径以外，因此，按照预算管理原则，国家财政反映长江委的支出要从水利基建和水利支出两个口径合并反映，同时还要剔除其中的教育、医疗、文化与传媒支出等，统计方式复杂。按照2007年的改革，以上原水利支出分别划入农林水事务类的水利支出、社会保障和就业支出、教育支出、科学技术支出、文化体育与传媒支出、医疗卫生支出、环境保护支出等，对于长江委而言，接受投资的方向和比率将有变化。虽说这次收支分类改革不改变原拨款口径，但是改革以后长江委内原有的教育支出、医疗支出、科学技术支出、文化与传媒支出等划入相关的功能支出大类，这些改革对水利事业单位均有极大的影响。
按照新的项级科目设置，水利支出款下设置行政运行、一般行政管理事务、机关服务、水利行业业务管理、水利工程建设、水利工程运行与维护、长江黄河等流域管理机构、水利前期工作、水利执法监督、水土保持、水资源管理与保护、水质检测、水文测报、防汛、抗旱等。由此可见，水利支出的行政运行、行政管理事务支出、机关服务支出等将成为今后政府支出统计与考核的重要部分。
2、应对支出功能分类改革的对策。水利事业单位而言，这次政府收支分类改革的目标清晰，就是要解决行政支出过大的难题和优化功能支出结构，对目前事业单位的现状 | 
